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Comme on l'a vu, Microsoft laisse une bonne partie du kernel de Windows 2000 inchangée par rapport à  NT 4.0. Le Gestionnaire des process, le Gestionnaire de sécurité, le Gestionnaire du cache et le Gestionnaire des E/S, par exemple, arrivent dans Windows 2000 directement de NT 4.0 sans modification.

Mais tous les sous-systèmes du kernel de Windows 2000 ont été améliorés pour optimiser
leurs performances et certains ont de nouvelles fonctions significatives. De plus,
Windows 2000 inclut les nouveaux sous-systèmes Gestionnaire PnP et Gestionnaire
de l’alimentation.